Talvez o equipamento mais barato para realizar este serviço sejam os coolers de HD. Custando em média R$20 um cooler duplo, faz muito bem seu serviço, podendo e sendo recomendado como uma eficaz e barata para resfriar um HD. O cooler deve ser instalado sobre a placa lógica do HD e não sobre a parte metálica dele. A placa por ser um componente eletrônico, não aguenta trabalhar em altas temperaturas, já o mecanismo interno do HD, sendo mecânico, aguenta um temperatura de trabalho superior. (Obrigado pela explicação mais "detalhada" Renato).
Dissipadores para HD <div class='bbimg'>http://www.zalman.co.kr/images/0311/zm-2hc1/ZM-2HC1_s1.gif' border='0' alt='Imagem postada pelo usuário' /></div>
Os dissipadores também são encontrados a venda - em bem menos quantidade - e também são eficazes, pórem, necessitam de um bom sistema de ventilação do gabinete para funcionarem perfeitamente. Você pode comprar um pronto ou simplesmente improvisar, fazendo o seu própio dissipador, que geralmente deve ser feito de alumínio ou cobre. Os dissipadores devem ser fixados na lateral do HD, e se possível, usar uma pequena quantidade de pasta térmica para ajudar na dissipação do calor.
Vale lembrar que é importante sim resfriar o HD, além de todas essas dicas, vale lembrar coisas simples como não deixar dois HD funcionando um em cima do outro, isso acaba deixando os dois muito mais quentes. De resto, aproveitem e deêm uma "gelada" nos hd's, eles agradecem
OBS: Como falado pelo Phoenyx, o Mother Board Monitor também faz a leitura da temperatura, é apenas uma questão de configuração.